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Herramientas computacionales para el análisis de datos “ómicos” de células del sistema inmune individuales: foco en scRNAseq;TCRseq, ATACseq y citometría espectral

Facultad de Química, Bioquímica y Farmacia

Categorización

Capacitación

Fecha de Inicio

06 – 11 – 2023

Responsables

Dra. Mariana MACCIONI

Dra. Eliane PIAGGIO

Colaboradores

Dr. Joshua WATERFALL

Dra. Jimena TOSELLO

Dr. Darío ROCHA

Dr. Nicolás NUÑEZ

Auxiliares

Biólogo Jeremías DUTTO

Bioq. Sabrina DOOGHE

Lic. Lucía BOFFELLI

Coordinador

Dr. Javier ELIÇABE

Destinatarios y Requisitos de Inscripción

Egresados con título de grado universitario o de nivel superior de 4 años o más en disciplinas vinculadas a la temática del curso.

Cupo

Mínimo: 30 personas.

Máximo: 50 personas

Proceso de Admisión

La admisión estará sujeta a selección basada en el mérito, la distribución geográfica e igualdad de género entre los aspirantes. Los interesados deben enviar un CV y un resumen de su trabajo junto a una carta de motivación que justifique la necesidad de implementar estas herramientas en sus trabajos de investigación. Todas las solicitudes serán revisadas por los organizadores y en caso de que el número de participantes supere el máximo establecido, se realizará una selección en función de su formación académica y científica, distribución geográfica y equilibrio de género. Los candidatos deberán demostrar conocimientos y experiencia en el uso del lenguaje de programación “R” y una buena comprensión del inglés.

Lugar del Dictado

Aula de posgrado de la FQBF de la Universidad Nacional de San Luis. Ejercito de los Andes 950, Bloque I PB

Cronograma de Actividades

 

Fecha

Tipo de actividad /temas a desarrollar

Docente/s responsable/s de la actividad

 

Ámbito

 

 

06/11/2023

9:00 hs – 9:30 hs Introducción general y presentación del curso. Presentación de los

participantes

Dra. Mariana Maccioni

Aula de postgrado de la FQBF de la Universidad

Nacional de

 

 

 

 

 

 

San Luis

9:30 hs – 10:30 hs

Descripción general de la genómica unicelular y el diseño de experimentos

Dra. Eliane Piaggio Dr. Joshua Waterfall

 

10:30 hs – 11 hs

Coffee Break

 

 

11:00 hs – 13:00 hs

Conceptos teóricos sobre cómo ejecutar un experimento scRNA/TCRseq

Dra. Jimena Tosello

 

13:00 hs – 14:30 hs

Almuerzo

 

 

14:30 hs – 16:30 hs

Análisis bioinformático de transcriptómica de células individuales

Dr. Joshua Waterfall Dr. Dario Rocha

 

16:30hs – 18:30 hs

Ejercicios prácticos en computadora

Dr. Joshua Waterfall Dr. Dario Rocha Dra. Jimena Tosello Lic. Jeremías Dutto

Bqca. Sabrina Dooghe Lic. Lucía Boffelli

 

 

 

 

 

 

07/11/2023

9:00 hs – 10:30 hs

Conceptos generales sobre biología de células T y secuenciación de TCR de células individuales

Dra. Jimena Tosello

 

 

Aula de postgrado de la FQBF de la Universidad Nacional de San Luis

 

10:30 hs – 11 hs

Coffee Break

 

 

 

 

 

11:00 hs – 13:00 hs

Discusión de trabajos científicos centrados en la transcriptómica de células individuales acoplada al análisis de TCR

Dr. Joshua Waterfall Dr. Dario Rocha Dra. Jimena Tosello Dr. Nicolas Nuñez Lic. Jeremías Dutto

Bqca. Sabrina Dooghe

Lic. Lucía Boffelli

 

13:00 hs – 14:30 hs

Almuerzo

 

14:30 hs – 15:30 hs

Herramientas e iniciativas públicas sobre genómica unicelular

Dr. Dario Rocha

15:30 hs – 16:00 hs

Coffee Break

 

16:00 hs – 17:00 hs

Descripción general de la regulación génica en la cromatina

Dr. Joshua Waterfall

17:00 – 18:30 hs

Introducción a la ATACseq de células

individuales.

Dra. Jimena Tosello

 

9:00 hs – 11:00 hs

Citometría de flujo de alta dimensión

Dr. Nicolas Nuñez

 

 

 

 

08/11/2023

 

11:00 hs – 13:00 hs

Ejercicios prácticos en computadora

 

13:00 hs – 14:30 hs

Almuerzo

 

Dr. Nicolas Nuñez Dr. Dario Rocha Lic. Jeremías Dutto

Bqca. Sabrina Dooghe Lic. Lucía Boffelli

Aula de postgrado de la FQBF de la Universidad Nacional de San Luis

 

14:30 hs – 15:30

Ejercicios prácticos en

Dr. Joshua Waterfall Dr. Dario Rocha

 

 

 

 

 

computadora y trabajo en grupos

 

15:30 hs – 16:00 hs

Coffee Break

 

16:00 hs – 18:30 hs

Presentaciones orales y conclusiones finales del curso

Dra. Jimena Tosello Dr. Nicolas Nuñez Lic. Jeremías Dutto Bqca. Sabrina Dooghe Lic. Lucía Boffelli

 

Dra. Mariana Maccioni

Dra. Eliane Piaggio Dr. Joshua Waterfall Dr. Dario Rocha Dra. Jimena Tosello Dr. Nicolas Nuñez

 

Arancel General

$18.000 (pesos dieciocho mil).

Beca al Docente de la UNSL

Tendrán un descuento del 10% sobre el arancel general, siendo el arancel final de $16.200 (pesos dieciseis mil doscientos). Además, se dispondrá de un sistema de becas que permita cubrir los gastos de inscripción.

Beca al Alumnos de la UNSL

Tendrán un descuento del 25% sobre el arancel general, siendo el arancel final de $13.500 (pesos trece mil quinientos). Además, se dispondrá de un sistema de becas que permita cubrir los gastos de inscripción.

Otras Becas

En función de la disponibilidad de financiamiento, se evaluara la posibilidad de otorgar becas para cubrir gastos de traslado y/o alojamiento por el tiempo que dure el curso. Los beneficiarios serán seleccionados entre los participantes aceptados en función de sus méritos, distribución geográfica e igualdad de género.

La Sociedad Argentina de Inmunología dispondrá de un sistema de becas para sus miembros para cubrir el arancel de inscripción al curso.

Informes

Resolución de Protocolización

Beca al Alumnos de la UNSL